Первые судебные учреждения на территории Якутии были организованы в 1783 году, в том числе, Аленский (Оленский) уездный суд на территории Верхневилюйского улуса.

В 1804 году в связи с упразднением уездов и образованием комиссарств уездные суды были упразднены, судебные функции были возложены на земских комиссаров по Вилюйскому уезду на Верхне-Вилюйское частное комиссарство, действовавшее до 1822 года.

С образованием в 1822 году Вилюйского округа делами по рассмотрению исков и прошений стали заниматься Вилюйское окружное управление, Верхне-Вилюйская инородная управа и родовые управления по наслегам улуса, а с 1867 года Вилюйское окружное полицейское управление. Также, были организованы заседательские участки, где большую часть дел единолично исполнял земский заседатель, который работал в качестве судебного исполнителя и следователя, имел собственное делопроизводство.

Верхневилюйский улус вместе с Едюгейским (Удюгейским) улусом составили 1-й земский участок с центром в г. Вилюйске. Деятельность земских участков была прекращена в 1897 году в связи отстранением от власти окружного исправника. В 1897 году были учреждены окружные судебно-мировые участки. Земские заседатели представляли отчеты мировому судье, как исполняющие обязанности судебных приставов.

С 1931 года Верхневилюйский районный суд Якутской АССР стал составной частью судебно-правовой системы страны.
По Постановлению Президиума ЯЦИК от 21 февраля 1931 года были внесены изменения в структуру органов юстиции, в связи с реорганизацией местных органов юстиции судебные участки были установлены в каждом административном районе с избранием народного судьи.

Постановлением за № 196 от 05 мая 1941 года ЧНК ЯАССР были утверждены 56 судебных участков, в том числе, 1-й участок Верхневилюйского района с центром в с. Верхневилюйск, 2-й судебный участок Верхневилюйского района с центром в с. Далыр. Постановлением Совета Министров Якутской АССР № 909 от 15 ноября 1946 года утвержден 51 судебный участок по ЯАССР, где 2-й судебный участок Верхневилюйского суда не значится, в Верхневилюйском районе был предусмотрен Верхневилюйский судебный участок с центром в с. Верхневилюйск. В период с 1946 года по 1960 год изменений в дислокации судов по Верхневилюйскому району не произошло.

С 1960 года на территории Якутской АССР суды были переименованы в народные суды. Судьи избирались Советами народных депутатов – органами власти, народные заседатели привлекались к рассмотрению дел по спискам, составленными тем же Советом.

До 31 декабря 1996 года согласно Закону РСФСР «О судоустройстве РСФСР» от 8 июля 1981 года районные (городские) суды именовались «народными», избирались народом, работали в составе народного судьи (народных судей) и народных заседателей, которые являлись носителями судебной власти и были уполномочены законом на отправление правосудия.

До войны, в тяжелые военные и послевоенные годы народными судьями Верхневилюйского улуса работали:

Харлампьев П.П. – июль-сентябрь 1920 года;
Очуров Тимофей Егорович – с сентября 1920 по 1921 год;
Дягилев Андрей Алексеевич – 1922 год – 03 декабря 1924 года;
Зедгенизов В.А., Павлов – в 1925 году;
Иванов Н.В. – с 7 января 1926 по 1927 годы;
Егоров Алексей Петрович – с 01 октября 1927 года по 25 апреля 1929 года;
Корякин Иннокентий Васильевич – с 26 апреля 1929 года;
Петров И.И. – с 1929 по 1932 год;
Колесников Р.И. – с 1933 год по июль 1934 года;
Кузьмин Феофан Павлович – с августа 1934 года по 1939 год;
Егоров Павел Петрович с января 1940 года по 1942 год;
Анисимов И.Д. – с декабря 1942 года по 1943 год;
Никифоров А.К. – с 1942 года по 1944 год;
Иннокентьев Степан Николаевич – с 1944 года по 1947 год;
с 1948 по 1951 год – Сафронов.

Народными судьями в Верхневилюйском районном суде в период с 1952 – 1999 годы работали:

Харлампьев П.П. – июль-сентябрь 1920 года;
с 1952 года по 1960 год Егорова Дария Трофимовна, народного судью замещал народный заседатель Тюляхов Савва Иванович;
с 1960 года по 1970 год Герасимова Елена Иннокентьевна, народного судью замещали народные заседатели Тюляхов Савва Иванович, Бубякин Николай Петрович, Семенов Данил Иванович;
с 1971 года по 1976 год Иванов Прокопий Васильевич;
с 1976 года по 1978 год Попов Николай Николаевич;
с 1979 года по 1982 год Степанов Николай Николаевич;
с 1982 года по 1989 год Ким Николай Хаирич, и.о. народного судьи народные заседатели Павлов Прокопий Васильевич, Кардашевская Вера Афанасьевна;
с 1989 года по 2015 год Кардашевская Вера Афанасьевна;
с 1991 года по 1992 год Егоров Семен Маркович;
с 1992 года по 1999 год Николаев Егор Николаевич.

Из воспоминаний Тюляхова Саввы Ивановича: «Я, с июля месяца 1943 года вступил на работу секретарем в первый участок Верхневилюйского народного суда. В то время за рекой в с. Далыр работал второй участок Верхневилюйского народного суда, судьей был Никифоров. В первом участке председателем работал Анисимов Ион Данилович, прокурором Горохов Христофор Константинович. В 1948 году в декабре председателем народного суда был избран окончивший юридическую школу Софронов Василий Ильич. Я с 1948 по 1975 годы был народным заседателем…».

Воспоминания Ивановой Елены Николаевны: «Летом в июне 1967 года в 19-ти летнем возрасте была принята на работу в Верхневилюйский народный суд, на должность секретаря судебного заседания. В то время народным судьей работала Герасимова Е.И., она была очень требовательным, в то же время была отзывчивым человеком, постоянно принимала участие во всем и давала советы. В то время проводилось много субботников, и во всех мероприятиях Елена Иннокентьевна принимала участие наравне со всеми. Вторым судьей, с которым я работала, был Иванов П.В. Он долгое время работал прокурором, был человеком мягким и отзывчивым, работал много допоздна, приходил на работу рано утром».

Воспоминания Иннокентьева Павла Васильевича, бывшего начальника Верхневилюйского УОВД, ветерана милиции: «Ким Николай Хаирич, родился в 1936 году в 3 Едюгейском наслеге Верхневилюйского района (ныне Дюллюкю). Во время войны переехали и жили в с. Чаппанда Нюрбинского района. Был избран судьей Вилюйского района, после этого до самой смерти работал судьей Вилюйского и Верхневилюйского районов. Так как, долгое время работал следователем, был тонким психологом, поэтому легко находил общий язык с людьми, никогда ни с кем не ссорился, был очень аккуратным, культурным, интеллигентным человеком…».

С принятием в 1993 году Конституции Российской Федерации судебная власть наравне с законодательной и исполнительной стала самостоятельной ветвью государственной власти. Началась судебная реформа, были приняты основополагающие законы, определяющие судебную систему. Произошли огромные позитивные изменения в финансовом, материально-техническом, кадровом обеспечении суда.

Председатели, возглавлявшие Верхневилюйский районный суд, внесли большой вклад в становлении и развитии суда. Сегодня, мы с благодарностью вспоминаем своих руководителей. Первым председателем Верхневилюйского районного суда Республики Саха (Якутия) был назначен Николаев Егор Николаевич, который возглавлял суд с 1992 года по 1999 год. За годы его работы председателем суда, с учетом аварийного здания суда, Верхневилюйским районным Советом народных депутатов суду было предоставлено 2-х этажное здание бытового комбината. С 1999 года по 2015 год Верхневилюйский районный суд возглавляла Кардашевская Вера Афанасьевна, под руководством которой был проведен капитальный ремонт здания суда.

8 января 1998 года был принят Федеральный закон «О Судебном департаменте при Верховном суде Российской Федерации», согласно которому функции организационного обеспечения судебной деятельности были переданы от Министерства юстиции федеральному государственному органу, действующему при судебной системе – Судебному департаменту.

С первых дней создания коллектив суда ощутил огромную поддержку со стороны руководства и аппарата Управления Судебного департамента в Республике Саха (Якутия). Благодаря большой поддержке начальника УСД в РС(Я) И.И. Корякина, заместителей начальника Н.Н. Дьячковского, С.С. Попова был проведен капитальный ремонт с реконструкцией здания суда, за короткий срок были созданы все условия для отправления правосудия.

Из интервью газете «Эхо столицы» от 10 октября 2008 года № 80 (1687) судьи Сосина Алексея Николаевича: «… Раньше здание районного суда было стареньким и ветхим. В качестве судьи Верхневилюйского районного суда я вложил много сил и на строительство нового, современного здания суда, поскольку я считаю, помещение, где царит Фемида, должно соответствовать торжественности и значительности судопроизводства. Так вот, подсудимый, вор-рецидивист, приговор, которому, кстати, согласно закону, звучал довольно сурово, поклонился и сказал, что в прошлую «ходку» приговор выслушивал в зале с обваливающейся штукатуркой. А в таком светлом, красивом зале не стыдно и приговор получить. И поклонился…».

В настоящее время правосудие в Верхневилюйском районном суде осуществляется двумя федеральными судьями Кириллиным Василием Александровичем (и.о. председателя суда), Никифоровым Айсеном Андреевичем, назначенными на должность в 2015, 2016 годах соответственно.

В рамках намеченных Региональным отделением Общероссийской общественной организации «Российское объединение судей» в Республике Саха (Якутия), по инициативе председателя Верхневилюйского районного суда Кириллина В.А., в юбилейный год совместно с Верхневилюйским республиканским лицеем-интернатом утвержден план работы и начал работу кружок для старшеклассников при суде «Правовые знания». Первыми воспитанниками кружка стали старшеклассники юридического направления ГБОУ «Верхневилюйский республиканский лицей-интернат им. М.А. Алексеева».

Деятельность суда в значительной степени зависит и от работы аппарата суда. Верхневилюйский районный суд гордится своими работниками, долгое время проработавшими в суде и отдающими все свои силы, знания и опыт делу обеспечения верховенства закона, защите прав и интересов граждан. Большим авторитетом пользуются секретарь судебного заседания Николаева Л.М., которая проработала более 20 лет. В данное время трудится в суде сторожем и передает свой бесценный опыт молодым кадрам. Более 20 лет работает в суде Саввинова А.Н., замещавшая за время своей работы, как в должности государственной гражданской службы, так и должности технического персонала.